保持板片的清潔是保持高傳熱系數的重要條件之一。在板片間，介質是沿著狹窄曲折的流道運動的，即使產生不太厚的垢層，也將引起流道的變化，顯著地影響流體的運動，使壓降增大，傳熱系數下降，例如某糖廠在采暖中使用板式換熱器，由于二次水沒有很好的處理，使用過程中僅兩個月就將流道堵塞，不能繼續運行。這種方法是將一種化學溶液循環地通過換熱器，使板片表面的污垢溶解、排出。
此法不需要拆開板式換熱器，簡化了清洗過程，也減輕了清洗的勞動程度。由于板片波紋能促進清洗液劇烈湍流，有利于垢層溶解，所以化學清洗法是比較理想的方法。這種方法是將板片后用刷子進行人工洗刷，從而達到清除板片表面污垢的目的。此法雖然比較直接，但對較堅硬、較厚的垢層。不易清洗干凈。對于污垢層比較堅硬又較厚的情況，單純采用上述一種方法都難以清洗干凈。綜合法是先用化學清洗法軟化垢層，再用機械（物理）清洗法除去垢層，以保持板片清潔干凈。
